Juan Seguín, voluit Juan Nepomuceno Seguín, (geboren 27 oktober 1806, Bexar, Nieuw-Spanje – overleden 27 augustus 1890, Nuevo Laredo, Mexico), revolutionair en politicus uit Tejano (Texaans van Spaans-Amerikaanse afkomst) die hielp de onafhankelijkheid van Texas te vestigen.
Nadat Mexico in 1821 onafhankelijk werd van Spanje, kreeg Stephen Austin – een vriend van Seguín’s vader – toestemming van Mexico om nederzettingen van Engels sprekende mensen te stichten in het Mexicaanse gebied Texas. Seguín en zijn vader, die ervan overtuigd waren dat de Spaans-Mexicaanse onrust en de inmenging van de Mexicaanse regering bijdroegen aan de economische onrust in Texas, schaarden zich aan de zijde van Austin in diens latere streven naar autonomie voor de regio. Seguín werd actief in de plaatselijke politiek en werd in 1829 verkozen tot wethouder in San Antonio en in 1833 tot burgemeester van die stad. De politieke spanningen tussen de Mexicaanse regering en zowel de Anglos (kolonisten van Europese afkomst of Europese immigranten) als de Tejanos in Texas liepen op, en beide groepen hadden bezwaar tegen het harde regime van de Mexicaanse president Antonio López de Santa Anna.
Om de daaruit voortvloeiende opstand in Texas de kop in te drukken, trok Santa Anna met zijn troepen het gebied binnen en belegerde vervolgens het Alamo, een missiefort in San Antonio, in februari 1836. Seguín was in de Alamo toen het beleg begon, maar hij werd met een brief naar Sam Houston, de opperbevelhebber van het leger van de Anglo-kolonisten, gestuurd met het verzoek om versterking. Hij was dus afwezig toen bijna iedereen in de Alamo op 6 maart 1836 door de Mexicaanse strijdkrachten werd gedood. De volgende maand vochten Seguín en zijn Tejano troepen aan de zijde van de Engelsen in de Slag bij San Jacinto, die eindigde in de nederlaag en gevangenneming van Santa Anna en de onafhankelijkheid van Texas.
In 1837 werd Seguín de eerste Tejano die zitting nam in de Senaat van de Republiek Texas, een functie die hij bekleedde tot 1840, toen hij werd herkozen als burgemeester van San Antonio. Tegen die tijd waren de spanningen toegenomen tussen de Tejano’s en de steeds groter wordende aantallen Anglo’s die zich in Texas vestigden. Veel Anglo’s wantrouwden de Tejanos – of begeerden gewoon hun land – en probeerden hen uit het Texaanse grondgebied te verwijderen. Seguín werd er uiteindelijk van beschuldigd de Mexicaanse regering te helpen bij de herovering van Texas, en hij werd in 1842 gedwongen met zijn familie naar Mexico te vluchten. Door de Mexicaanse regering werd Seguín gezien als een verrader vanwege zijn rol in de onafhankelijkheid van Texas. Hij kreeg de keuze tussen een lange gevangenisstraf of dienst in het Mexicaanse leger. Hij koos voor het laatste en vocht tegen de Verenigde Staten in de Mexicaans-Amerikaanse oorlog (1846-48).
Seguín keerde na de oorlog terug naar Texas en werd veeboer; kort daarna werd hij gekozen tot plaatselijke vrederechter. Hij bleef in Texas tot 1867, toen aanhoudende Amerikaanse wrok hem dwong definitief naar Mexico te verhuizen, waar hij tot aan zijn dood bleef. De stad Seguín, gelegen net buiten San Antonio, is naar hem genoemd.