PMC

W ostatnich latach nastąpił gwałtowny wzrost wiedzy na temat sekwencji DNA ludzkiego genomu. Równocześnie rozwinęły się wysokowydajne technologie analizy genomu i zmienności genetycznej, pozwalające na uzyskanie ilości informacji genetycznej o wiele większej niż było to możliwe jeszcze kilka lat temu. Doprowadziło to do gwałtownego wzrostu liczby badań mających na celu zrozumienie genetycznego podłoża złożonych chorób, a następnie do ogromnej liczby doniesień z tych badań. Można się spodziewać, że w najbliższych latach wzrost ten będzie jeszcze szybszy. W przypadku alergii, podobnie jak innych chorób złożonych, zarówno badania powiązań, jak i asocjacji przyniosły w większości niejednoznaczne wnioski – po interesujących wynikach często następował brak replikacji przez inne grupy badawcze. Na tym tle, The Hereditary Basis of Allergic Diseases jest śmiałym przedsięwzięciem, aby spróbować objąć ten temat. Czytelnik, który szuka obszernego przeglądu wyników powiązań i asocjacji będzie zawiedziony; z drugiej strony, niewiele jednoznacznych wniosków na temat alergii zostało do tej pory osiągniętych i taki tekst prawdopodobnie zdezaktualizowałby się dość szybko. Problem ten został w znacznym stopniu ominięty przez redaktorów S. T. Holgate i J. W. Holloway, którzy skupili się w głównej części książki nie tylko na możliwych genetycznych czynnikach etiologicznych, ale także na zagadnieniach mechanistycznych.

W pierwszym z 11 rozdziałów Tarja Laitinen daje inspirujące wprowadzenie do dziedziczności alergii i astmy, które obejmuje tematy specyficzne dla choroby, takie jak badania bliźniąt i rodzin oraz sposoby dziedziczenia, a następnie bardziej ogólną sekcję dotyczącą modeli choroby złożonych chorób, kwestii strategicznych i roli selekcji w próbach mapowania. Głównym wnioskiem z tego rozdziału jest to, że dziedziczność astmy jest rzędu 60%-80%. Pomimo znacznych wysiłków, nie można wyciągnąć jasnych wniosków z badań powiązań i asocjacji, co sugeruje, że na poziomie populacji dziesiątki różnych loci są zaangażowane w rozwój astmy i że znaczna heterogenność locus istnieje między rodzinami.

W drugim rozdziale opisano skany genomu dla astmy. Tylko cztery skany genomowe są opisane szczegółowo. Ponieważ nie można wyciągnąć żadnych jasnych wniosków i ponieważ od czasu publikacji książki, skany genomowe z bardziej znaczącymi wynikami zostały zgłoszone i nadal będą zgłaszane, ten rozdział wkrótce będzie miał głównie znaczenie historyczne. W tym rozdziale, podobnie jak w pozostałych rozdziałach, podawane są imponujące wartości P, które mogą prowadzić niedoświadczonego czytelnika do fałszywych wniosków. Dyskusja na temat znaczenia genomewide, tutaj lub w innym miejscu w książce, byłaby odpowiednia.

W trzecim rozdziale omówiono rolę populacji założycielskich w mapowaniu złożonych genów chorób. Rozdział ten jest głównie bardzo krótkim opisem (pięć stron długości) badań autorki (Carole Ober) w Hutterites.

Następnych siedem rozdziałów omawia rolę różnych funkcjonalnych genów kandydujących lub rodzin genów w chorobach alergicznych lub, raczej, w astmie. Podobnie jak w pozostałej części książki, niewiele lub wcale nie omówiono innych fenotypów klinicznych alergii, takich jak alergiczny nieżyt nosa czy atopowe zapalenie skóry. Może bardziej odpowiednim tytułem dla tej książki byłoby „Dziedziczne podstawy astmy.”

Znaczenie immunologicznych odpowiedzi regulacyjnych jest omówione w rozdziale N. Hizawy na temat genetycznej regulacji specyficznej reaktywności IgE i w rozdziale A. H. Mansura na temat zmienności genetycznej w loci HLA i TCR oraz na temat rozwoju alergii i astmy. Te dwa rozdziały zawierają bardzo szczegółowe omówienia i >200 piśmiennictwa. W rozdziale N. Hizawy znajduje się dyskusja na temat regionów kandydujących sugerowanych przez skanowanie genomu, w których maksymalne wyniki NPL wynosiły od 2,23 do 1,28. Po pierwsze, należało podkreślić, że wyniki NPL nie są tożsame z powszechnymi wynikami LOD, a po drugie, należało podkreślić, że uzyskane wartości P są dalekie od osiągnięcia istotności genomowej i są bardzo prawdopodobne, że są to obserwacje fałszywie dodatnie z powodu przypadku.

W rozdziale 6 omówiono region chromosomalny 11q13, jeden z pierwszych regionów kandydujących, który został zidentyfikowany przez powiązanie z atopią. Ponownie, po wstępnych pozytywnych ustaleniach następuje kilka wspierających badań, ale także kilka negatywnych doniesień. Co ciekawe, niektóre z tych badań wskazują na matczyne dziedziczenie podatności na chorobę. Szczególne zainteresowanie wzbudził jeden oczywisty funkcjonalny gen kandydujący zlokalizowany w tym regionie, a mianowicie gen kodujący podjednostkę β receptora IgE o wysokim powinowactwie. Kilka badań donosi o powiązaniach między polimorfizmami tego genu a miarami atopii, ale, ponownie, kilka badań nie odtwarza tych wyników.

W kolejnych rozdziałach omówiono szereg funkcjonalnych genów kandydujących, w tym geny dla IL-13, receptorów IL-13, IL-9 i receptora IL-9; geny dla syntaz tlenku azotu; oraz geny zaangażowane w regulację produkcji i aktywności leukotrienów. W tych rozdziałach główny nacisk położony jest na astmę – do pewnego stopnia na etiologię choroby, ale w większym stopniu na mechanizmy patofizjologiczne. Szczególnie w rozdziale o leukotrienach omówiono ważny temat genetycznie uwarunkowanej odpowiedzi na leczenie. Tylko w tym rozdziale wymieniono 140 pozycji.

W ostatnim, krótkim rozdziale omówiono geny wpływające na ciężkość astmy i zakres, w jakim te geny mogą lub nie mogą się różnić od genów o znaczeniu etiologicznym. Przeprowadzono tylko ograniczoną liczbę badań dotyczących ciężkości choroby, dlatego omówiono tylko kilka genów, w tym geny dla IL-4 i jej receptora, receptora β2-adrenergicznego i dla α1-antytrypsyny.

Czytelnik, który szuka szczegółowego przeglądu genetycznych metod epidemiologicznych i wyników badań nad chorobami alergicznymi, powinien szukać tych informacji gdzie indziej. Z drugiej strony, książka zawiera dokładny opis wielu funkcjonalnych genów kandydujących, które mogą być zaangażowane w etiologię tych chorób i które z pewnością są ważne dla patofizjologii. Pod tym względem większość rozdziałów jest bardzo pouczająca, a lista piśmiennictwa jest obszerna (łącznie 700). Należy jednak pamiętać, że nadal nie można przewidzieć, w jakim stopniu genetyczna podatność na alergię i astmę będzie wyjaśniona przez zmienność w oczywistych funkcjonalnych genach kandydujących. Kilka z ostatnich bardzo nagłośnionych badań nad genami podatności na alergię zidentyfikowało geny, których nikt by nie podejrzewał, takie jak ADAM33 (chromosom 20), PHF11 (chromosom 13), DPP10 (chromosom 2) i GPRA (chromosom 7), ale należy podkreślić, że obecnie nie jest jasne, w jakim stopniu te geny wyjaśniają część genetycznej podatności na choroby alergiczne.

.

Dodaj komentarz

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.