PMC

Viime vuosina tietämys ihmisen perimän DNA-sekvenssistä on kasvanut räjähdysmäisesti. Samanaikaisesti on kehitetty genomin ja geneettisen variaation analysointiin tarkoitettuja korkean läpimenotehon tekniikoita, jotka mahdollistavat geneettisen informaation louhimisen moninkertaisesti suuremmalla määrällä kuin vielä muutama vuosi sitten oli mahdollista. Tämä on johtanut monitahoisten sairauksien geneettisen taustan ymmärtämiseen tähtäävien tutkimusten määrän dramaattiseen kasvuun, minkä seurauksena tutkimuksista on laadittu valtava määrä raportteja. Tämän kasvun voidaan odottaa kiihtyvän entisestään tulevina vuosina. Allergian, kuten muidenkin monitahoisten sairauksien osalta, sekä linkitys- että assosiointitutkimukset ovat tuottaneet enimmäkseen epäselviä johtopäätöksiä – kiinnostavia tuloksia on usein seurannut se, että muut tutkimusryhmät eivät ole pystyneet toistamaan niitä. Tätä taustaa vasten The Hereditary Basis of Allergic Diseases on rohkea yritys yrittää käsitellä aihetta. Lukija, joka kaipaa laajaa katsausta kytkentä- ja assosiaatiotuloksiin, joutuu pettymään; toisaalta allergiasta on toistaiseksi tehty vain vähän yksiselitteisiä johtopäätöksiä, ja tällainen teksti vanhentuisi todennäköisesti melko nopeasti. Toimittajat S. T. Holgate ja J. W. Holloway välttävät tämän ongelman suurelta osin keskittymällä kirjan keskeisissä osissa paitsi mahdollisiin geneettisiin etiologisiin tekijöihin myös mekanistisiin kysymyksiin.

Ensimmäisessä 11 luvusta Tarja Laitinen antaa innostavan johdannon allergian ja astman perinnöllisyyteen, jossa käsitellään tautikohtaisia aiheita, kuten kaksos- ja perhetutkimuksia ja periytymistapoja, ja sen jälkeen yleisemmässä osiossa käsitellään monimutkaisten tautien tautimalleja, strategisia kysymyksiä ja valinnan merkitystä kartoitusyrityksissä. Tämän luvun tärkein johtopäätös on, että astman periytyvyys on 60-80 prosentin luokkaa. Huomattavista ponnisteluista huolimatta linkitys- ja assosiaatiotutkimuksista ei voida tehdä selkeitä johtopäätöksiä, mikä viittaa siihen, että populaatiotasolla kymmenet eri lokukset ovat osallisina astman kehittymisessä ja että perheiden välillä on merkittävää lokusten välistä heterogeenisuutta.

Toisessa luvussa kuvataan astman genomitutkimuksia. Vain neljä genomiskannausta kuvataan yksityiskohtaisesti. Koska selkeitä johtopäätöksiä ei voida tehdä ja koska kirjan julkaisemisen jälkeen on raportoitu ja raportoidaan jatkossakin genomiskannauksia, joiden tulokset ovat merkittävämpiä, tämä luku on pian lähinnä historiallisesti kiinnostava. Tässä luvussa, kuten muissakin luvuissa, raportoidaan vaikuttavia P-arvoja, jotka saattavat johtaa kokemattoman lukijan vääriin johtopäätöksiin. Tässä tai muualla kirjassa olisi ollut paikallaan keskustella genomin laajuisesta merkitsevyydestä.

Kolmannessa luvussa käsitellään perustajapopulaatioiden roolia monimutkaisten tautigeenien kartoittamisessa. Luku on lähinnä hyvin lyhyt kuvaus (viisi sivua pitkä) kirjoittajan(Carole Oberin) tutkimuksista hutterilaisilla.

Seitsemässä seuraavassa luvussa käsitellään erilaisten funktionaalisten kandidaattigeenien tai geeniperheiden roolia allergisissa sairauksissa tai pikemminkin astmassa. Kuten muussakin kirjassa, muita kliinisiä allergiafenotyyppejä, kuten allergista nuhaa tai atooppista ihottumaa, käsitellään vain vähän tai ei lainkaan. Ehkä sopivampi nimi kirjalle olisi ollut ”Astman perinnöllinen perusta.”

Immuunin säätelyvasteiden merkitystä käsitellään N. Hizawan luvussa, joka käsittelee spesifisen IgE-reaktiivisuuden geneettistä säätelyä, ja A. H. Mansurin luvussa, joka käsittelee geneettistä variaatiota HLA- ja TCR-looseissa sekä allergian ja astman kehittymistä. Nämä kaksi lukua sisältävät hyvin yksityiskohtaisia keskusteluja ja >200 viittausta. N. Hizawan luvussa on jonkin verran keskustelua ehdokasalueista, joita ehdotettiin genomiskannauksessa, jossa NPL-arvojen maksimipisteet olivat välillä 2,23-1,28. Ensinnäkin olisi pitänyt korostaa, että NPL-pisteet eivät ole sama kuin yleiset LOD-pisteet, ja toiseksi olisi pitänyt korostaa, että saadut P-arvot ovat kaukana genomin laajuisesta merkitsevyydestä ja ovat hyvin todennäköisesti sattumasta johtuvia vääriä positiivisia havaintoja.

Luvussa 6 käsitellään kromosomialuetta 11q13, joka on yksi ensimmäisistä ehdokkaista alueista, jotka on tunnistettu atopian linkittämisen perusteella. Jälleen kerran ensimmäisiä positiivisia löydöksiä seuraa muutama niitä tukeva tutkimus mutta myös useita negatiivisia raportteja. Mielenkiintoista on, että jotkin tutkimukset osoittavat tautialttiuden periytyvän äidiltä. Erityistä kiinnostusta on herättänyt yksi ilmeinen toiminnallinen geeniehdokas, joka sijaitsee tällä alueella, nimittäin korkean affiniteetin IgE-reseptorin β-alayksikköä koodaava geeni. Useissa tutkimuksissa raportoidaan tämän geenin polymorfismien ja atopian mittareiden välisestä assosiaatiosta, mutta jälleen useat tutkimukset eivät pysty toistamaan näitä löydöksiä.

Seuraavissa luvuissa käsitellään useita funktionaalisia geeniehdokkaita, mukaan lukien IL-13:n, IL-13-reseptoreiden,IL-9:n ja IL-9-reseptorin geenit, typpioksidisyntaasien geenit ja leukotrieenien tuotannon ja aktiivisuuden säätelyyn osallistuvat geenit. Näissä luvuissa pääpaino on astmassa – jossain määrin taudin etiologiassa mutta suuremmassa määrin patofysiologisissa mekanismeissa. Erityisesti leukotrieenejä käsittelevässä luvussa käsitellään tärkeää geneettisesti määräytyvää hoitovastetta. Pelkästään tässä luvussa luetellaan 140 viitettä.

Viimeisessä lyhyessä luvussa käsitellään astman vaikeusasteeseen vaikuttavia geenejä ja sitä, missä määrin nämä geenit eroavat tai eivät eroa etiologisesti tärkeistä geeneistä. Taudin vaikeusastetta koskevia tutkimuksia on tehty vain rajallinen määrä, joten vain muutamia geenejä käsitellään, mukaan lukien IL-4:n ja sen reseptorin, β2-adrenergisen reseptorin ja α1-antitrypsiinin geenit.

Lukijan, joka haluaa yksityiskohtaisen katsauksen geneettisiin epidemiologisiin menetelmiin ja allergisia sairauksia koskevien tutkimusten tuloksiin, on etsittävä nämä tiedot muualta. Toisaalta kirjassa annetaan perusteellinen kuvaus useista toiminnallisista kandidaattigeeneistä, jotka saattavat olla osallisina näiden sairauksien etiologiassa ja jotka ovat varmasti tärkeitä patofysiologian kannalta. Tältä osin useimmat luvut ovat hyvin informatiivisia, ja lähdeluettelo on laaja (yhteensä 700). On kuitenkin muistettava, että on edelleen mahdotonta ennustaa, missä määrin geneettinen alttius allergialle ja astmalle selittyy ilmeisten funktionaalisten ehdokasgeenien vaihtelulla. Muutamissa viimeaikaisissa paljon julkisuutta saaneissa allergia-alttiusgeenejä koskevissa tutkimuksissa on löydetty geenejä, joita kukaan ei olisi epäillyt, kuten ADAM33 (kromosomi 20), PHF11 (kromosomi 13), DPP10 (kromosomi 2) ja GPRA (kromosomi 7), mutta on tärkeää korostaa, että tällä hetkellä ei ole selvää, missä määrin nämä geenit selittävät osan geneettisestä alttiudesta allergisille sairauksille.

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.