Bestuur van het Directorium
De staatsfinanciën waren totaal in wanorde. De regering kon haar uitgaven alleen dekken door plunderingen en tribuutbetalingen aan het buitenland. Het Directorium was voortdurend in oorlog met buitenlandse coalities, die op verschillende momenten Groot-Brittannië, Oostenrijk, Pruisen, het Koninkrijk Napels, Rusland en het Ottomaanse Rijk omvatten. Het Directoire annexeerde België en de linkeroever van de Rijn, terwijl Napoleon Bonaparte een groot deel van Italië veroverde. Het Repertorium stichtte zes kortstondige zusterrepublieken naar het voorbeeld van Frankrijk in Italië, Zwitserland en Nederland. De veroverde steden en staten moesten enorme hoeveelheden geld en kunstschatten naar Frankrijk sturen, die werden gebruikt om het nieuwe Louvre museum in Parijs te vullen. Een leger onder leiding van Bonaparte veroverde Egypte en trok op tot Saint-Jean-d’Acre in Syrië. Het Directorium versloeg een opleving van de Oorlog in de Vendée, de door royalisten geleide burgeroorlog in de Vendée, maar faalde in zijn opzet om de Ierse opstand van 1798 te steunen en een Ierse Republiek te stichten. De oorlogen putten de staatsbegroting uit, maar als er vrede wordt gesloten, keren de legers terug naar huis en moeten de bestuurders het hoofd bieden aan de ergernis van de achterban, die zijn middelen van bestaan heeft verloren, en aan de ambitie van de generaals, die hen elk moment terzijde kunnen schuiven.
Het Directorium stelt de willekeurige executies van het Terreurbewind aan de kaak, maar voert ook grootscheepse illegale repressies en zelfs massamoorden op burgers uit (Oorlog in de Vendée). De falende economie en de hoge kosten van levensmiddelen troffen vooral de armen. Hoewel het Directorium het republicanisme toegedaan was, wantrouwde het de bestaande, zij het beperkte, democratie. Toen de verkiezingen van 1798 en 1799 door de oppositie werden gewonnen, gebruikte het Directorium het leger om oppositieleiders gevangen te zetten en te verbannen en oppositiekranten te sluiten. Ook in buitenlandse en binnenlandse zaken, waaronder financiën, was men in toenemende mate afhankelijk van het leger. Barras en Rewbell waren berucht om hun corruptie en schermden met corruptie bij anderen. Het beschermheerschap van de directeuren was ondankbaar en het algemene wanbeheer verhoogde hun impopulariteit.
Publieke onenigheid
Met de instelling van het Directorium hadden hedendaagse waarnemers kunnen aannemen dat de Revolutie voorbij was. De burgers van het door oorlog vermoeide land wilden stabiliteit, vrede en een einde aan omstandigheden die soms aan chaos grensden. De rechtsen die de monarchie wilden herstellen door Lodewijk XVIII op de troon te zetten, en de linksen die het Terreurbewind wilden verlengen, probeerden maar faalden om het Directorium omver te werpen. De eerdere gruweldaden hadden vertrouwen of goodwill tussen de partijen onmogelijk gemaakt.
Het nieuwe regime stuitte op verzet van Jacobijnen ter linkerzijde en Royalisten (in het geheim gesubsidieerd door de Britse regering) ter rechterzijde. Het leger onderdrukte rellen en contrarevolutionaire activiteiten, maar de opstandelingen en met name Napoleon kregen massaal de macht. Bij de verkiezingen van 1797 voor een derde van de zetels behaalden de Royalisten de overgrote meerderheid en stonden zij op het punt bij de volgende verkiezing het Directorium in handen te krijgen. Het Directorium reageerde door alle winnaars te zuiveren met de staatsgreep van 18 Fructidor, 57 leiders te verbannen naar Guyana met een zekere dood als gevolg en 42 kranten te sluiten. Tegelijkertijd wees het democratische verkiezingen af en behield het zijn oude leiders aan de macht.
Gestuurd door Napoleon vanuit Italië, bestormen Pierre Augereau en zijn troepen de Tuilerieën en nemen de generaals Charles Pichegru en Willot gevangen. Staatsgreep van 18 Fructidor, jaar V (4 september 1797). Gravure van Berthault, naar een tekening van Girardet.
Op 4 september 1797, met het leger op zijn plaats, werd de staatsgreep van 18 Fructidor, jaar V in gang gezet. De soldaten van generaal Augereau arresteerden Pichegru, Barthélemy en de belangrijkste royalistische afgevaardigden van de Raden. De volgende dag annuleerde het Directorium de verkiezingen van ongeveer tweehonderd afgevaardigden in 53 departementen. 65 afgevaardigden werden naar Guyana gedeporteerd, 42 royalistische kranten werden gesloten en 65 journalisten en redacteuren werden gedeporteerd.
Op 9 november 1799 (18 Brumaire van het jaar VIII) pleegde Napoleon Bonaparte de staatsgreep van 18 Brumaire, waarbij het Consulaat werd geïnstalleerd. Dit leidde in feite tot de dictatuur van Bonaparte en in 1804 tot zijn proclamatie tot keizer. Hiermee kwam een einde aan de specifiek republikeinse fase van de Franse Revolutie.
Historici hebben het Directorium beoordeeld als een regering van eigenbelang in plaats van deugd, die elke aanspraak op idealisme had verloren. Het had nooit een sterke basis van steun onder de bevolking. Wanneer er verkiezingen werden gehouden, werden de meeste kandidaten verslagen. De resultaten waren onbeduidend en de aanpak weerspiegelde een nieuwe wending in de richting van de dictatuur en de mislukking van de liberale democratie. Geweld, arbitraire en dubieuze vormen van rechtspraak en hardhandige repressie waren methoden die door het Repertorium vaak werden gebruikt.